挑戦モードでは本編でやり逃した拠点イベントやサブミッション、挑戦モードのミッションを行うことができます。
本編でやり逃した拠点イベントはすべて実行できるわけではないようです。
やり逃したサブミッションに関してはすべて実行可能です。
そして「とるぅえんど」を見るために必要な条件イベントは挑戦モードにすべて出てきます。
挑戦モードのミッションをすべて終わらせ、主要キャラのスペシャルイベントを見ると拠点イベントに「とるぅえんど」が出現します。

• 挑戦モードのボス
  
• アベルトを倒せ

• コパンドン再加入。
• 拠点イベント「四天王マジック訪問」でマジック再加入。
• ロッキーのスペシャルイベントを見ると復讐ちゃん加入。
• タマネギのスペシャルイベントを見て、ムシ使いの村跡へ行くとセヤダタラ加入。
• 拠点イベント「さらば復讐ちゃん」を実行すると復讐ちゃん永久離脱。

暴動中の料亭を救え、暴動中のTV局を救え、暴動中の国家体育館を救え、ネオペンタゴンを倒せは拠点イベント「四天王マジック訪問」のあとから選択可能。

ダンジョン:サクラ&パスタ

1. 1F 女子更衣室でレシピの鍵を宝箱から入手
2. 2F 厨房前の☆を見る
3. 2F 事務室で冷蔵庫の鍵をもらう
4. -2F の冷蔵庫で宝箱からういろーを入手
5. 再度 2F の厨房へ

ダンジョン:ゼスTV

ダンジョン:国家体育館

ダンジョン:ゼス首都

• 逃げ遅れた部隊の救出 で通ったルートを忘れやすいみたい
• 各色の鍵が一個ずつ必要
• 最後に出現する★ (20 個目) は、あげはレーダーに表示されない (場所は逃げ遅れた部隊の救出でカミーラと遭遇したあたり)
• 残り２部隊となった時、もしマップで５階左上に★がある場合、エレベーターから５階で降り、突然落ちるフロアから行くと残存部隊に出会える。
• 最後の１部隊の魔物将軍はマップ右中下辺。

ダンジョン:マンタリ森

• ロドネーの「この先の工場で待っている～」は無視しないとゲームオーバーになるので注意

ダンジョン:跳躍の塔

• 一度目は塔部分に、塔でのイベント後に地下部分に行きます
• 本編で闘技場をクリアしていない場合はこのときにも行くことができます(グナガンを倒した後だともうひとつ挑戦状をもらえます。)

一度目(塔部分)

• タタミ返しx1 が増援として現れる

二度目(地下部分) ,前列,後列 ,アムンゼン,フローズン ,合成魔獣改,パパイア ,アムンゼン,神風

• 合成魔獣改x3 が増援として現れる

ダンジョン:永久地下牢

ミッション:アベルトを倒せ
ダンジョン:ペトロ山洞窟

• アジトの周囲の森
• 廃坑洞窟F
• 秋の森
• ハニワ平原
• ムシ使いの村跡
• 王立博物館
• イタリア2級市民街
• 女の子刑務所
• ノクタン鉱山
• 第3試験会場
• 廃棄迷宮

廃坑洞窟Fとノクタン鉱山、ハニワ平原と第3試験会場はそれぞれダンジョンに入るごとに交互に移動先に入ります。

• ペトロ山洞窟 (ミッション アベルトを倒せ)
• マンタリ森 (ミッション ネオペンタゴンを倒せ)
• 跳躍の塔 (ミッション パパイア成敗)
• 跳躍の塔(塔部分) (ミッション パパイア成敗(地下))
• ゼス首都 (モンスター残存部隊を殲滅せよ)
• サクラ&パスタ (ミッション 暴動中の料亭を救え)
• ゼスTV (ミッション 暴動中のTV局を救え)
• 国家体育館 (ミッション 暴動中の国家体育館を救え)
• 永久地下牢 (ミッション 魔人カミーラを犯せ)

主要キャラ

• キムチ(=ランス)
• シィル
• リズナ
• かなみ
• 志津香
• マリア
• カオル
• セル
• マジック
• サーナキア
• カロリア
• コパンドン
• パットン
• ロッキー
• タマネギ

• 上記のキャラのスペシャルイベントを全て見て、ミッション「アベルトを倒せ」を完了させると拠点イベントに出現
• キムチ、シィル、かなみ、志津香、マリア、カロリアのスペシャルイベントは本編でも可。

• セヤダタラ:女の子モンスターコンプ&タマネギのFRを30にする
• 復讐ちゃん:ロッキーのスペシャルイベント